中美雙方在清潔能源領域有著共同訴求，且具有較強互補性，合作空間巨大，但雙方合作仍面臨諸多挑戰。

　　據中國石化報7月30日報道，中美雙方已在清潔能源領域建立定期交流和磋商機制，使雙方在該領域的合作可以有條不紊地推進，但中美兩國清潔能源領域的合作仍存在出口限制、碳關稅、關稅壁壘、知識產權等諸多不確定因素挑戰。

　　首先，美國出口管制體系在一定程度上阻礙雙方合作。目前，中國希望從美國進口清潔能源設備和技術。然而，美國政府對華高科技出口管制在很大程度上限制美國企業和中國同行合作，很多美國企業寧可在中國設立一個獨資工廠，也不愿將這些高新技術轉讓給中國。

　　其次，中美雙方在碳關稅問題上存在明顯分歧，相關貿易摩擦增加將在一定程度上影響兩國清潔能源合作。

基于中美兩國發展階段有所不同，其在新能源和清潔發展領域的政策、態度和出發點也存在差異，這也是影響雙方合作的不確定因素。