制藥工廠的選址和總圖廠址選擇國內外測試資料表明，不同地區、不同環境的大氣含塵、含菌濃度差異很大。為了有效控制潔凈車間中新風的含塵量與含菌量，在新建、遷建或改建藥廠時，廠址宜選在大氣含塵、含菌濃度較低，自然環境和水質良好，周圍無嚴重污染源的地方，這是建設醫藥工業凈化工程潔凈廠房的必要前提。以此為原則，廠區應避開市內工業集中的地區，遠離鐵路、碼頭、機場、交通要道以及散發大量粉塵、煙氣和有害氣體的地方。當由于條件所限，不能遠離時，則應位于嚴重空氣污染源的最大頻率風向的上風側。

　　歐美等發達國家的絕大部分藥廠，均設在環境幽雅、空氣潔凈的城鎮遠郊。
　　廠區周圍一般都留有較大的樹木和草地，有的則設在專門的綠化區中，如美國奧索( Ortho)的雷力店廠、欣泰克斯(Syntex)的保羅一阿托廠、凱利(Kll)醫療器械廠、荷蘭的歐加農( Organon)制藥廠等”1。達些藥廠不僅廠址選擇了優美的環境，而且在廠內總體布置上也著重考慮了環境的清潔及衛生問題，因此能夠形成一個空氣潔凈，無噪聲污染的環境。