首先，輸送介質不同。泥漿泵是最早的泵型，一般采用鑄鐵制作，耐磨性能低，作為鉆探機械的重要組成部分，只能用來輸送泥漿或者含有懸浮顆粒的漿體;渣漿泵主要應用于礦山行業中，用來輸送含渣的漿體，同時也可以用來輸送泥漿，但應用較少。由于渣漿泵在工作過程中過流件更容易受到漿體的沖擊、磨損、腐蝕等，因此通常渣漿泵會內襯耐磨材料，如高鉻合金、橡膠等高耐磨材質，從而形成耐磨渣漿泵。這樣可有效降低渣漿泵內部的磨損，所以目前市場上所用的渣漿泵大多都為耐磨渣漿泵。
其次，泥漿泵需要配備輔助設備，而渣漿泵不需要。泥漿泵工作時，常常需要與高壓清水泵配合使用，高壓泵將大于泥漿泵壓力的清水輸送至防漏填料，對填料進行防護，否則容易使密封部分發生磨損;而耐磨渣漿泵可單獨完成輸送工作，無需配備其他輔助設備。
最后，工作原理不同。泥漿泵是電機通過連桿機構帶動活塞運動，從而引起泥漿泵內密閉室容積的變化，形成泵室內外壓力差的變化，從而完成吸水和排水過程;耐磨渣漿泵工作時則是由電機帶動葉輪旋轉，即葉輪對漿體做功，使漿體的動能增加。同時，漿體由于慣性向葉輪邊緣流去，并以很高的速度由排出管排出。
此外，由于兩種泵的應用介質不同，因而所應用的領域也會有所不同。渣漿泵主要應用在冶金、電力、礦山、煤炭等工業部門中輸送帶固體顆粒的漿料，而泥漿泵一直以來都是主要用于鉆探、制藥、釀造、造紙等行業輸送懸浮漿液。